Doktorand - Entwicklung von mikrobiellen Bioprozessen für die Gewinnung funktionaler Peptide für industrielle Anwendungen (m/w/d)

Ihr Profil:

• Ein abgeschlossenes Masterstudium im Bereich Biotechnologie, Bioverfahrenstechnik, Biologie oder eine verwandte Disziplin
• Sie sind interessiert am Einsatz von Hochdurchsatz-Methoden im Labor und an der Optimierung biotechnologischer Prozesse
• Sie sind bereit, sich ggf. in neue experimentelle Methoden (z.B. Molekularbiologie, Protein /Peptidaufreinigung, Kultivierung, Laborautomatisierung) einzuarbeiten
• Sie haben Grundkenntnisse im Bereich Programmierung bzw. Research Software Engineering (z.B. Python, GitLab) oder sind bereit sich die Kenntnisse mit Unterstützung anzueignen
• Sie besitzen ein hohes Maß an Selbstständigkeit, Motivation und Zuverlässigkeit
• Sie zeigen eine sehr zuverlässige, strukturierte und ordentliche Arbeitsweise
• Sie haben fließende Englischkenntnisse, sowohl mündlich als auch schriftlich (B2-Niveau nach dem CEFR ), idealerweise nachgewiesen durch ein Zertifikat
• Sie zeichnen sich durch hohe Selbstständigkeit aus und Bereitschaft zu großem Engagement
• Sie haben einen sehr zuverlässigen, gewissenhaften und selbstständigen Arbeitsstil
• Sie haben ausgeprägte Teamfähigkeit sowie die Fähigkeit zur kooperativen Zusammenarbeit in einem transdisziplinären Projektumfeld

Ihre Aufgaben:

• Entwicklung und Programmierung neuer automatisierter Workflows für die Beschleunigung und Parallelisierung der Molekularbiologie mit Laborrobotik (Opentrons, OT-2)
• Molekularbiologische Stammkonstruktion für die intrazelluläre und sekretorische Produktion von Peptiden
• Entwicklung und Programmierung neuer automatisierter Workflows für die automatisierte Bioprozessentwicklung (TECAN Freedom Evo 200 mit integriertem BioLector XT)
• Kultivierung und Screening von mikrobiellen Stammbibliotheken im Batch- und Fed-Batch-Modus auf einer automatisierten Mikrokultivierungsplattform, z. B. BioLector-Mikrokultivierungssystem mit TECAN Freedom EvoNutzung von Methoden der künstlichen Intelligenz (KI) und des maschinellen Lernens (ML) für die Datenauswertung, die Planung der nächsten Generation von Experimenten und die Ableitung von biologischem oder prozesstechnischem Know-how für die Optimierung der Bioprozesse
• Kultivierung in 4-fach parallelen Laborbioreaktoren (Eppendorf) im Batch- und Fed-Batch-Modus und Skalierung bis in den 50-L-Bioreaktormaßstab
• Selbstständige Auswertung und Präsentation der Ergebnisse der eigenen Arbeit
• Eigenständige Reflexion der eigenen Ergebnisse und Weiterentwicklung des Themas, Präsentation der Projektergebnisse in internen Formaten und Austausch mit internen und externen Projektpartnern auch in englischer Sprache
• Verfassen von wissenschaftlichen Publikationen und Projektberichten auch in englischer Sprache
• Betreuung von Studierenden im Rahmen von Forschungspraktika und Abschlussarbeiten als Teil des eigenen Projektes
• Teilnahme an nationalen und internationalen Konferenzen mit Präsentation Ihrer Forschungsergebnisse